Ninja masih ada di Jepang sampai sekarang. Jumlahnya sekitar 200.000. Organisasi ninja NIN (Intelijen Nasional NINJA) tidak dikendalikan oleh pemerintah sipil, dengan anggota elitnya melakukan pembunuhan dan sabotase secara rahasia. Ada organisasi yang menentang NIN: UN (Under Ninja). Ninja versus n