Di Jepang pada tahun 2035, sebuah kecelakaan yang dikenal sebagai "Burst" terjadi selama proyek penelitian, memunculkan bentuk kehidupan buatan yang tidak terkendali yang disebut "Matter" yang telah menyebar ke seluruh Ngarai Kurobe. Kota penelitian yang pernah dipuji sebagai harapan umat manusia in